一切都好像尘埃落定，卡卡西和凯最终还是没能成功追击到大蛇丸。
自来也在赶到之后，只发现了沉睡的鸣人三个人，检查之后发现周围虽然有九尾的查克拉残留但很微弱。
鸣人身上的封印也没有被破坏的情况，显然当时他看到的不是真正的九尾。
虽然失望没有抓住大蛇丸，但终究九尾没出问题，让他也放松一些。
他将鸣人和佐助、小樱带走，回到了木叶村之中。
而团藏呢，一直没有抓大蛇丸，实际上并不是他的手下想象的那样是怕折损自己的实力。
其实是因为他一直都在和大蛇丸暗中勾结，他手臂上那一堆的写轮眼，都是大蛇丸帮他弄好的。
之后，木叶村顺利击退砂忍和音忍。
马基在一个坑洞中发现了风影的尸体，才知道风影已经被大蛇丸给杀了，当时是假的风影在控制他们。
砂忍将所有的罪过怪在大蛇丸的身上，直接投降。
木叶村为了休养生息，只能够接受投降，毕竟他们这边失去了自己的火影。
于是乎，木叶开始了重建的阶段。
众人参加了三代火影的葬礼，各种感伤。
自来也坐在自己房间之中的床上，脑海中不知道在想些什么。
“老师啊，你也终于结束了生命。”他道。
“我这些年一直都在想，大蛇丸是不是真的有错呢？”
“他自幼父母双亡，经历过战争，知道人生命的脆弱，所以一直想着研究长生不死之术。”
“实际上，他心里想的还是我们这群人。”
“老师，他真的错了吗？”
说到这里的时候，自来也转了身：“那么，你又有没有错呢？”
“我最近回来才知道，鸣人这些年过得什么生活。”
“他一个孩子，作为四代目火影，作为一个英雄的儿子，却始终不能公布身份，让他一直喝着过期牛奶长大。”
“所有人都对他各种的仇视……”
“我见到了砂忍村的那个孩子，一尾的人柱力。和鸣人一样的待遇，然后变成了杀人武器。”
“还有佐助的宇智波家族，当初整个家族被屠杀，这么大的事情就不了了之？”
“宇智波想要反叛，也是因为团藏对宇智波家族的压迫。可如果没有你的默许，那些坏事，团藏怎么做得出来？”
瞬间，自来也越加疑惑了。
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