幕一样，莱昂准将率领联邦军队很快便攻入圣路易斯城。普赖斯率领的3000民兵被击溃，只得率领1400余名民兵沿堪萨斯河上游逃走。莱昂亲自率领2000名联邦士兵追击，普赖斯彻底被击败，只剩下几百人逃至密苏里州的中部的沙利文。
莱昂准将留2000名联邦士兵驻守圣路易斯城，率领7000余人攻向密苏里州的首府杰斐逊城。而此时，杰斐逊城除了州长杰克逊自己组建的5000爱尔兰独立军，还有普赖斯留下的3000密苏里州民兵，双方兵力相当，武器装备也相当，训练程度更是差不多相同，也就是基本都没经过什么军事训练。
两方都是十分笨拙地向对方开火，没有任何战术之类的可言，互有折损。最后，见占不了便宜，莱昂准将率领4000余人退回圣路易斯城，而杰克逊这边也损失近千人的部队。密苏里州的战事就此僵持起来。
弗吉尼亚州的西部地区，因为与俄亥俄州有长远的交界线，加上巴尔的摩至俄亥俄的巴-俄铁路线经过这里，以及俄亥俄河流经该地区边界，这里成为争夺的战略要地。5月初，南部联盟国由罗伯特*加尼特将军率领的5000名部队，进入这里，首先抢占了哈珀斯渡口以西地带，直接切断了巴-俄铁路线，让联邦的军队无法经巴-俄铁路快速调动。无奈之下，联邦战争部任命乔治*麦克莱伦少将从俄亥俄州出发，组织了一支20000人的俄亥俄民兵进入弗吉尼亚州的西部地区边界，并派遣了一支先头部队于5月中旬渡过了俄亥俄河，占领了巴-俄线上的格拉夫顿，继续向南开进。
而肯塔基州则也是风雨飘摇。作为联邦总统亚伯拉罕*林肯和南方联盟国杰斐逊*戴维斯的共同故乡，州长贝里亚*梅戈芬虽然掌控议会对外通告说保持中立，但随着形势的发展，密苏里州宣布脱离北方联邦之后，他的想法也慢慢开始了转变，毕竟，除了北面，东西南三面都是敌占区，梅戈芬不想肯塔基州成为双方的主战场。
在梅戈芬的默许下，从肯塔基州的路易斯维尔至南部联盟国田纳西州的纳什维尔之间的铁路，成了肯塔基州对南部进行军用物资交易的主要通道。不但如此，梅戈芬州长还秘密允许南部联盟国的军人代表在这里征兵，许多肯塔基州的民众偷偷进入田纳西边境，加入南部联盟国的军队中。
这个时候，肯塔基州议会中越来越多的议员们却倾向于忠于联邦，并且为了防备有叛乱，议会组建了家乡自卫队，而已经准备倒向南部联盟国的州长梅戈芬，也组建了肯塔基州自卫队，双方
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