消毒之后，作为缝合伤口的线。等这些让华佗觉得匪夷所思的准备工作完成之后，一场比较实验开始了。
赵兴找来二十个需要实施外科手术的重病人，分成两组，一组进行了反复除菌之后，放入无菌手术室，由“全副武装”的华佗实施手术。另一组就简单了，直接往干净一点的房间里面一丢，按照华佗以往的方法治疗。两组病人在手术之后的恢复愈合情况让华佗大吃一惊。
第一组伤口恢复快，发烧的明显少于第二组，而且最后没有死亡的情况；第二组正好相反，尽管华佗医术高明，也是全心全意地救治，但还是因为伤口感染，死掉了四个，活下来的六个恢复速度明显慢于第一组，病人的痛苦也要强于第一组。
这一下，华佗真得相信这世上有一种眼睛看不见，但却是十分致命的东西存在了。理解了细菌的存在，华佗随后也就理解了赵兴对于感染瘟疫死亡的人为什么要“隔离焚烧深埋”的苦心，从此无怨无悔地成为赵兴的拥护者，不遗余力地向所有人讲解瘟疫防控方法和要点。
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