木叶35年，雨之国跟火之国的战争迎来终结，在木叶不断的兵力增援下，半藏最终不堪重负签下了停战协议书。
而因为长达两年的征战，半藏一开始为自己跟雨之国扬名的目的虽已做到，但是也导致本来就穷的雨之国，变得更为的穷困潦倒。
雨之国的人民不懂半藏的用意, 认为是半藏肆意的挑起战争，导致雨之国变得更加的民不聊生，此时雨之国中民怨四起。
雨之国跟火之国的战争结束，但却不代表第二次忍界大战就这么结束了，整个忍界的战火已被彻底点燃。
在木叶第一次在雨之国失利以后，岩隐作为第一个按捺不住的忍村, 成为了五大忍村中第三个加入忍战的五大忍村。
同年，雨隐看到木叶多线开战, 内部已经焦头烂额，最终铤而走险的派遣忍者潜入木叶强捉人柱力。
此刻的木叶村多线开战，村中的忍者跟防御力量已经多半外出，玖辛奈也被云隐成功得手。
最终还是靠着一路遗留下的红色头发，被同年级的波风水门给发现，并且成功救回，两人因此互生好感。
云隐再次强抢人柱力不成，因为单方面的再次撕毁约定，未免木叶秋后算账，所以选择先下手为强，同样卷入第二忍战之中。
雨之国战役结束以后，木叶三忍被三代火影加急找回村子，准备将他们派往其他阵线支援。
但是三忍中的自来也，却因为看到战斗的雨之国心生怜悯，最终决定违抗三代火影的命令，决定教导几个战争孤儿活下去的生存能力。
而这几个战争孤儿, 名为长门、弥彦、以及小南。
自来也会留下来的原因，一部分是他在弥彦三人的眼中，看到了名为希望的东西。
一部分原因则是看到了长门的眼睛，鬼使神差的想到了大蛤蟆仙人的预言。
长门他们三个作为战争孤儿，对于进入他们国家的木叶忍者，一开始自然是带满了仇恨的。
因为就是忍者跟战争，他们才失去了家人跟家园。
长门拥有传说中“仙人之眼”，现在又有了这样的仇恨，一想起大蛤蟆仙人的预言，自来也认为自己有必要指导预言之子走向正轨，所以他最终决定留下来。
“自来也，你想过这么做的后果吗？如今的木叶多线开战，战力本来就紧缺，但是你却决定留下来照顾这几个孤儿？”
大蛇丸自己也是战争孤儿，他也明白这些孩子，如果运气不好的话，很难在
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