“蝼蚁尚且偷生，何况是人呢？”
“你觉得你能逃走吗？就算你能从我的保镖们手里逃脱，你也逃不过组织的追杀，组织的叛徒是什么下场你应该很清楚吧？”
增山远笑了笑没有说话，以莎朗·温亚德为掩护突出了重围。
随后增山远一把将莎朗·温亚德打晕，然后和紧追不舍的保镖们玩起了捉迷藏。
在逃跑的过程中，增山远抽取了一些莎朗·温亚德的血液，接着掏出手机给诺亚发了邮件，把组织boss的真实身份告诉了诺亚，并拜托他把这一消息转告其他人。
片刻后，宫野姐妹，柯南，安室透，诸伏景光，工藤夫妇......总之跟组织有关系的人都知道了boss的身份。
接着增山远联络了大和芳子，告诉了他自己采集了boss的血液，并把血液所在的位置跟她说了。
然后增山远带着莎朗·温亚德一路狂奔来到了一座桥上。
那些保镖紧随其后，增山远站在桥上，当着一众保镖的面扭断了莎朗·温亚德的脖子，然后从大桥上一跃而下。
当天晚上，梅洛和boss同归于尽的消息传遍了整个组织。
boss的死引起了巨大的轰动，组织瞬间就变得乱了起来。
组织的boss生前最信任的三个人，贝尔摩德，琴酒，朗姆自然而然就成为了最有资格继任组织boss的人。
组织内部因此分裂成了三股势力，互相争斗，公安和fbi乘机对组织进行围剿，消灭了组织大量的有生力量。
但可惜的是，琴酒，贝尔摩德，朗姆三人都没有被抓到。
不知不觉，大半年过去了。
这大半年时间里，柯学世界有了翻天覆地的变化，科技发达程度已经跟增山远穿越前没什么区别了。
毛利小五郎在柯南的帮助下，和原著中一样成为了东京最负盛名的名侦探。
柯南也跟原著一样，用蝴蝶结变声器帮忙破案，他躲藏的地方越来越显眼，举动越来越嚣张，但偏偏大家就是看不到他。
正当柯南混的风生水起的时候，灰原哀的aptx4869有了巨大突破，在猴子身上的实验成功率高达90%。
90%这个成功率已经可以进行人体实验了，而第一只“小白鼠”自然就是迫不及待的柯南同学了。
灰原哀和增山雪根据柯南的基因制作aptx4869的解药，柯南服用解药之后变回了工藤新一。
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