装配上足够的兵器，但和江淮战役的时候相比，无论是兵力总数，还是整体的作战能力，都得到了明显的提高。另外在海军部的，下属还有三万六千多兵力，其中可以用于陆战的兵力可以达到一万五千人，这也是一支不可忽视的辅足力量。
因此在盘点完了自己现有的兵力之后，商毅又一次清楚的认识到，和自己刚刚来到这个时代相比,自己己经拥有了足够强大的实力,手下有一支强大的军队,有超过二十万平方公里的领地,有八百多万民众,拥有足够的财力物力,甚致还占领了两个大型海岛,也就是说，就算是失败了，也有足够的后路可退，那还怕什么，就再和清军大战一场就是了。
不过由于军队的扩大，也使商家军在未来的大兵团作战会增加，而目前最高的师级编制显然不能符合现在的作战要求，因此商毅也决定，在师级以上，再提高一级，进行军级编制，将目前的全部兵力编成五个军。
浙江战区，第一军：下辖第一、五、九师，第一、五旅。由成进任军长，赵英杰任副军长，尤洪亮任参谋长，付责驻守江南地区，总指挥部设在杭州；第二军：辖第三、四师、六师，第三旅，由罗运斌任军长，王信任副军长，刘伯涛任参谋长，付责驻守江北地区，总指挥部设在扬州；第三军：辖第九师、骑兵师、特种兵大队和第六旅，由杨武丞任军长、段鹏任副军长。属于机动兵力，江南江北调动作战，但总指挥部仍然设在杭州。
山东战区，第四军：辖第二师、第二、四旅、骑兵旅和特种兵团。由周少桓任军长、蒋义渠任副军长，唐镇任参谋长，付责驻守整个山东战区，总指挥部设在登州；第五军：辖第八师，第七旅，军长由周少桓兼任，童大勇任副军长，鲍铜钢任参谋长，付责驻守州地区，总指挥部设在穆陵关，平时由童大勇代理军长的职权。
对于这样的新编制，统战部的其他人员都有意见，毕竟现在全军己经有十个师的编制，如果还按师为最高级战斗编制，确实会使指挥权过于分散。稍微有一点出人意料的是，由周少桓一人身兼两个军的军长，不过山东战区离浙江确太远了，既使是有了飞鸽传书，也来不及做到极时的指挥，因此需要一个统一的指挥部。而且第五军的人数明显偏少，实际只有半个军。
因为时间里迫，军部的成员也各兼任以前师级职务，因此人员也不需要重新调整，可以说很快就能快完整编，而商毅也开始考虑，在南京失守之后，商家军的整体作战安排。
现在清军的战略计划己经十分清楚了，就是在山
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