南京清军在严我公的命令下，放弃外郭城防御，弃守外十八城门，退守内十三城门。
过程很顺利，明军没有趁势进攻。
当天，明军接管了外郭城十八门。第二天一早，朱以海率领大批文武以及御营将士，乘舟船沿秦淮河而进。
沿途经过定准门、清凉门、石城门、三山门、水门、聚宝门、水门、通济门、正阳门等诸城门前，城上清军十分紧张，站在城墙上摒住呼吸，小心翼翼的目视着明军路过。
自城西绕过城南，一直到了城南的正阳门外，舍舟登陆，往钟山孝陵而去。
路过山川坛，进入祭祀，这是大明朝为祭祀太岁、风、云、雷、雨、五岳、五镇、四海、钟山、天寿山以及京畿山川、都城隍诸神之所。
接着往拜大祀坛，大明朝天、地合祀，对天地的祭拜活动都在正阳门外的天坛圜丘举行，这是一座两层的圆形建筑，四面各九级台阶。
南京沦陷半年多以来，这里还算保存完好。
朱以海率百官献上三牲祭品，祭祀皇天后土。
祭祀之时，正阳门内的严我公还特意请钱谦益代表清廷，也送来了祭品。
祭祀完天地，继续向北，至朝阳门外。
严我公派人提前准备了许多酒水饭菜供明军食用，又送了不少牲畜祭品。
“殿下，朝阳门经孝陵卫至孝陵西北皇墙还有四十五里，原来护陵驻军有五千多人，陵园内亭阁相接，松涛林海，养长生寿千头，鹿鸣其间，气势非凡。”钱谦益做为北使，一路相陪。
“如今呢？”朱以海问。
孝陵是明太祖朱元璋和马皇后合葬陵，洪武十五年马皇后去世，九月葬入孝陵，定名为孝阮，一说是马皇后谥孝慈，取谥中孝字，也说有以孝治天下之意。
整个孝陵建成，动用几十万军民，历时三十余年才建成，规模宏大，建筑雄传，建在朝阳门外的钟山，被围在外郭城墙内。
南朝七十寺，有一大半都被围在孝陵禁苑中。
终明一朝，南京孝陵都一直是祖宗根本之地，备受尊崇。每年有固定的三大祭、五小祭，凡遇国之大事，均需遣勋戚大臣祭告。
当年朱棣起兵靖难，攻陷南京，建文帝不知所终，群臣上表劝进，朱棣推辞两次后，前往谒拜孝陵，然后正式继位。
而如今，南京城虽还没攻破，但清军已经被迫退入内城，外城打开，朱以海率北伐诸军、御营文武前来谒孝陵，也是有着重大意义
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