以此建立海峡的重要贸易中转站，后来多次打退苏门答腊强国亚齐的进攻，可没料到海上马车夫荷兰人到来后，因为双方属于不同的阵营，一个是新教，一个是天主教，荷兰人围困许久后，夺取了马六甲城。
荷兰人一边在爪哇建立巴达维亚港，一边夺取了马六甲，掌控了东西方两大海峡航道，葡萄牙人进出也只能交纳高昂的费用。
南洋那些群岛土着，在室利佛逝等曾经的大国崩灭后，渐渐的形成了巫族从苏门答腊岛转移到马来半岛，占据马来半岛，也就是马来人，而爪哇人占领着马来群岛的格局。
这些群岛土着都几乎改信了新月教。
荷兰人征服了爪哇群岛，暹罗的大城王朝却也将马来半岛北部的吉打等五个国家变成自己的藩属。
随着马六甲被荷兰人从葡萄牙人手里夺取，马来半岛也开始被荷兰人划为自己的势力范围，他们意图独家垄断香料贸易，连英国人都被他们拒之门外。
而对于制订了重商贸易策略的大明绍天朝来说，这种局面也是不能接受的，这几年大明的商船已经开始遍及几大洋，直航美洲和欧洲。大明的水师，也在朝鲜、琉求、日本、安南、占城、吕宋等地不断开拓新的据点，有租的有抢的有占的，如今成了南洋一股新势力。
西班牙和荷兰人对大明是既想合作贸易，又怀着深深恐惧，对他们殖民地里的华人控制也越来越强。
荷兰人更是不想让大明进入马六甲海峡和巽他海峡。
英国葡萄牙等国商船来大明经过海峡，都要缴重税，甚至有时还会被抢劫，很不安全，大明的商船过两个海峡时，同样既要缴重税也不安全。
南洋水师舰队，虽然在大纳土纳岛建立了要塞军港，毕竟不能直接控制海峡，所以大明其实一直早就打算在马六甲海峡弄一块地盘了。
只是地盘都是有主的，尤其是荷兰人早把柔佛等马六甲周边各国，视为自己的附庸，哪容他人染指。
当时在马六甲海峡的东南角是柔佛苏丹国，在一百多年前，马六甲被葡萄牙人占领后，苏丹马末沙逃至柔佛民丹岛，以此为基地企图夺回马六甲，可数次反攻都没成功，反而招来葡萄牙人从印度果阿调来的舰队摧毁了民丹岛，马末沙仓皇逃到苏门答腊甘帕，不久驾崩。
他死后，其长子阿拉乌丁二世放弃马六甲苏丹称号，创建了具有马六甲王室血统的柔佛王朝，定都旧柔佛，而其兄弟穆沙法沙则远赴霹雳建立了新的霹雳王朝，原来马六甲王朝统治区域一分
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