一次，曹操与荀攸面谈，洞知荀攸之才，便对荀彧、钟繇说："公达非平常之人，我等能与他一同共事，造化安能不好？"便调荀攸来到自己身边，当了军师。
两年后，曹操欲伐张绣。荀攸觉得形势不利曹操，劝道："张绣和刘表互相依靠，战力强大。若攻，他俩必合，难灭；若缓，他俩生隙，可剿。"曹操不听，出兵张绣，刘表果然发兵相救，曹军失利。不久，曹操听取荀攸之计，分别破了张绣、刘表联盟。
曹操征讨吕布，吕布退守下邳城池，久攻不下。因于连年征战，曹军疲惫至极，曹操想收兵撤退。荀攸偕同郭嘉力劝曹操坚持，并建议引沂水、泗水灌城，水淹下邳。此举奏效，下邳城破，缢杀吕布。
公元200年二月，袁绍拉开"官渡之战"序幕。袁绍大将颜良率兵围攻白马。四月，曹操亲自北上解救白马。荀攸认为，如此正面与强大袁军硬拼，必败，不如伪装渡河佯攻袁绍后方，待袁绍分兵后，再派轻骑突袭围攻白马的袁军。曹操纳之，果获大胜，颜良也在此役中被关羽斩杀。
白马之围既解，曹操率六百骑兵押送粮草辎重沿河西退，不想遭遇袁绍六千追兵。敌众我寡，诸将惧怕，求曹退守大营。荀攸说："歼敌良际，为何要退？"言罢急献一计，于是曹军解鞍放马，丢弃辎重。袁军以为曹军怯战败逃，争抢"战利品"，曹操突令将士反冲，大破袁军，并杀袁绍大将文丑。
袁绍谋士许攸叛投曹操时，其实曹操有过怀疑，但荀攸与贾诩力劝曹操相信于他。等到曹操带精兵攻下乌巢后，正面攻打曹洪的袁绍大将张郃、高览，生怕遭受出战不力之罪，欲投曹营。曹洪生疑，不予接受。荀攸对曹洪说："张郃因自己计谋不被袁绍采用来投，您怀疑他干吗？"从而让曹操白得了两个大将，几万兵马。
公元203年，袁绍长子袁潭与其弟袁尚反目。袁谭遣谋士辛毗请降曹操。其时曹操正想攻打荆州刘表，不理辛毗。荀攸劝导："刘表没有君临天下之志，可先搁置，袁家势力尚剩，今兄弟生隙，正可分而除之。"曹操听从。之后形势走向，一如荀攸所料。
平定冀州后，曹操上奏汉献帝为荀攸封爵，汉献帝遂封荀攸陵树亭侯。公元207年，曹操下令论功行赏，称"公达为人忠诚正直而善于密谋。"增邑四百，并前七百户，转为中军师。之后荀攸减少随军，而是留守后方，掌管刑罚之责，后又担任尚书令。
曹操不仅自己尊重荀攸，而且督导曹丕尊敬荀攸。有次曹丕前去慰问生病的荀攸，就在床下
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